Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3CAP42336 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3CAP42336 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms