Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIITAP33076 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIITAP33076 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIITAP33076 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIITAP33076 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIITAP33076 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIITAP33076 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIITAP33076 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CIITAP33076 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CIITAP33076 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CIITAP33076 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CIITAP33076 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIITAP33076 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIITAP33076 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms