Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNE1P24864 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNE1P24864 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms