Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GADD45AP24522 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GADD45AP24522 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms