Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHCGRP22888 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHCGRP22888 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHCGRP22888 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHCGRP22888 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms