Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDCP19113 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDCP19113 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDCP19113 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HDCP19113 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDCP19113 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDCP19113 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDCP19113 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDCP19113 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms