Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XBP1P17861 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XBP1P17861 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XBP1P17861 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XBP1P17861 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XBP1P17861 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XBP1P17861 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XBP1P17861 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XBP1P17861 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XBP1P17861 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XBP1P17861 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XBP1P17861 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XBP1P17861 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XBP1P17861 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XBP1P17861 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms