Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF7P17544 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF7P17544 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF7P17544 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF7P17544 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF7P17544 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF7P17544 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF7P17544 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF7P17544 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms