Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NGFRP08138 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NGFRP08138 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NGFRP08138 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NGFRP08138 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NGFRP08138 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NGFRP08138 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NGFRP08138 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NGFRP08138 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms