Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAVP06756 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms