Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TFAP2AP05549 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFAP2AP05549 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2AP05549 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms