Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGHV3-7P01780 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV3-7P01780 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms