Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGKV1-17P01599 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms