Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WISP3O95389 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WISP3O95389 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WISP3O95389 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
WISP3O95389 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WISP3O95389 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WISP3O95389 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WISP3O95389 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WISP3O95389 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WISP3O95389 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WISP3O95389 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WISP3O95389 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms