Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRMUO75648 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRMUO75648 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRMUO75648 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRMUO75648 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRMUO75648 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms