Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC45O75419 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC45O75419 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC45O75419 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC45O75419 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC45O75419 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC45O75419 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC45O75419 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC45O75419 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC45O75419 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC45O75419 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC45O75419 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC45O75419 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC45O75419 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC45O75419 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC45O75419 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC45O75419 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC45O75419 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC45O75419 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC45O75419 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms