Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL41O60662 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL41O60662 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms