Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZIC3O60481 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC3O60481 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms