Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BUD23O43709 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BUD23O43709 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BUD23O43709 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BUD23O43709 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BUD23O43709 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BUD23O43709 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BUD23O43709 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms