Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSTPIP1O43586 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSTPIP1O43586 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms