Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN9O14815 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN9O14815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms