Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFXANKO14593 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFXANKO14593 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFXANKO14593 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RFXANKO14593 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms