Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA5AO00534 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA5AO00534 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms