Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN8O00124 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBXN8O00124 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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