Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TARSL2A2RTX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TARSL2A2RTX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms