Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRNP3Q8WYN3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms