Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSAMQ8N6F7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSAMQ8N6F7 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms