Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ASB15-201ENST00000275699 2706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ABCC12-201ENST00000311303 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 PPT1-219ENST00000642050 4010 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 DGCR11-201ENST00000609958 2214 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MDH1B-201ENST00000374412 2553 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 FOSB-201ENST00000353609 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AC027682.7-201ENST00000623147 2121 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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UBE2V1Q13404 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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UBE2V1Q13404 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SRGAP2-AS1-202ENST00000437515 2504 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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UBE2V1Q13404 CTAGE8-201ENST00000487179 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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UBE2V1Q13404 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TFIP11-202ENST00000407148 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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UBE2V1Q13404 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 C16orf96-201ENST00000444310 3823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 N4BP2L1-202ENST00000380130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
UBE2V1Q13404 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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