RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486333.1

CTAGE4-201, Transcript of CTAGE family member 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTAGE4, Length 2,588 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE4-201ENST00000486333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.08■■□□□ 1.12
CTAGE4-201ENST00000486333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.38■□□□□ 0.69
CTAGE4-201ENST00000486333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CTAGE4-201ENST00000486333 HRCP23327 699 aa19.21■□□□□ 0.67
CTAGE4-201ENST00000486333 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.03■□□□□ 0.64
CTAGE4-201ENST00000486333 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.89■□□□□ 0.62
CTAGE4-201ENST00000486333 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.88■□□□□ 0.61
CTAGE4-201ENST00000486333 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CTAGE4-201ENST00000486333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTAGE4-201ENST00000486333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.55■□□□□ 0.56
CTAGE4-201ENST00000486333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.55■□□□□ 0.56
CTAGE4-201ENST00000486333 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.42■□□□□ 0.54
CTAGE4-201ENST00000486333 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CTAGE4-201ENST00000486333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.3■□□□□ 0.52
CTAGE4-201ENST00000486333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CTAGE4-201ENST00000486333 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CTAGE4-201ENST00000486333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CTAGE4-201ENST00000486333 ABCC9O60706 1549 aa17.84■□□□□ 0.45
CTAGE4-201ENST00000486333 TRIM41Q8WV44 630 aa17.79■□□□□ 0.44
CTAGE4-201ENST00000486333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
CTAGE4-201ENST00000486333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CTAGE4-201ENST00000486333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.68■□□□□ 0.42
CTAGE4-201ENST00000486333 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
CTAGE4-201ENST00000486333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.66■□□□□ 0.42
CTAGE4-201ENST00000486333 NEUROD1Q13562 356 aa17.65■□□□□ 0.42
CTAGE4-201ENST00000486333 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CTAGE4-201ENST00000486333 SCRIBQ14160 1630 aa17.54■□□□□ 0.4
CTAGE4-201ENST00000486333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.53■□□□□ 0.4
CTAGE4-201ENST00000486333 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
CTAGE4-201ENST00000486333 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTAGE4-201ENST00000486333 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CTAGE4-201ENST00000486333 MYT1Q01538 1121 aa17.43■□□□□ 0.38
CTAGE4-201ENST00000486333 NACADO15069 1562 aa17.31■□□□□ 0.36
CTAGE4-201ENST00000486333 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.27■□□□□ 0.36
CTAGE4-201ENST00000486333 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CTAGE4-201ENST00000486333 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.25■□□□□ 0.35
CTAGE4-201ENST00000486333 WIZO95785 1651 aa17.21■□□□□ 0.34
CTAGE4-201ENST00000486333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.18■□□□□ 0.34
CTAGE4-201ENST00000486333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CTAGE4-201ENST00000486333 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CTAGE4-201ENST00000486333 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CTAGE4-201ENST00000486333 CEP162Q5TB80 1403 aa17.11■□□□□ 0.33
CTAGE4-201ENST00000486333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
CTAGE4-201ENST00000486333 MIER1Q8N108 512 aa17.05■□□□□ 0.32
CTAGE4-201ENST00000486333 ABCC8Q09428 1581 aa17.04■□□□□ 0.32
CTAGE4-201ENST00000486333 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.04■□□□□ 0.32
CTAGE4-201ENST00000486333 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.99■□□□□ 0.31
CTAGE4-201ENST00000486333 SOGA1O94964 1423 aa16.97■□□□□ 0.31
CTAGE4-201ENST00000486333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CTAGE4-201ENST00000486333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.88■□□□□ 0.29
CTAGE4-201ENST00000486333 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTAGE4-201ENST00000486333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CTAGE4-201ENST00000486333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.85■□□□□ 0.29
CTAGE4-201ENST00000486333 EEA1Q15075 1411 aa16.83■□□□□ 0.28
CTAGE4-201ENST00000486333 SMARCA2P51531 1590 aa16.82■□□□□ 0.28
CTAGE4-201ENST00000486333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.82■□□□□ 0.28
CTAGE4-201ENST00000486333 GOLGA3Q08378 1498 aa16.81■□□□□ 0.28
CTAGE4-201ENST00000486333 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTAGE4-201ENST00000486333 SMARCA4P51532 1647 aa16.72■□□□□ 0.27
CTAGE4-201ENST00000486333 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.7■□□□□ 0.26
CTAGE4-201ENST00000486333 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.68■□□□□ 0.26
CTAGE4-201ENST00000486333 CLIP1P30622 1438 aa16.67■□□□□ 0.26
CTAGE4-201ENST00000486333 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.65■□□□□ 0.26
CTAGE4-201ENST00000486333 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.64■□□□□ 0.26
CTAGE4-201ENST00000486333 KIF21BO75037 1637 aa16.63■□□□□ 0.25
CTAGE4-201ENST00000486333 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.62■□□□□ 0.25
CTAGE4-201ENST00000486333 APLP2Q06481 763 aa16.58■□□□□ 0.24
CTAGE4-201ENST00000486333 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CTAGE4-201ENST00000486333 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.55■□□□□ 0.24
CTAGE4-201ENST00000486333 SYNJ1O43426 1573 aa16.55■□□□□ 0.24
CTAGE4-201ENST00000486333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
CTAGE4-201ENST00000486333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CTAGE4-201ENST00000486333 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.52■□□□□ 0.23
CTAGE4-201ENST00000486333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CTAGE4-201ENST00000486333 KCNH8Q96L42 1107 aa16.43■□□□□ 0.22
CTAGE4-201ENST00000486333 BCL11AQ9H165 835 aa16.4■□□□□ 0.22
CTAGE4-201ENST00000486333 BCANQ96GW7 911 aa16.39■□□□□ 0.22
CTAGE4-201ENST00000486333 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CTAGE4-201ENST00000486333 ARAP1Q96P48 1450 aa16.35■□□□□ 0.21
CTAGE4-201ENST00000486333 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTAGE4-201ENST00000486333 FKBP8Q14318 412 aa16.32■□□□□ 0.2
CTAGE4-201ENST00000486333 CUX2O14529 1486 aa16.31■□□□□ 0.2
CTAGE4-201ENST00000486333 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.31■□□□□ 0.2
CTAGE4-201ENST00000486333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.25■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.25■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 TOP2BQ02880 1626 aa16.25■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 ITGAEP38570 1179 aa16.24■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 MAPKBP1O60336 1514 aa16.24■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 PRXQ9BXM0 1461 aa16.23■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CTAGE4-201ENST00000486333 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.2■□□□□ 0.18
CTAGE4-201ENST00000486333 WDR97A6NE52 1622 aa16.17■□□□□ 0.18
CTAGE4-201ENST00000486333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.17■□□□□ 0.18
CTAGE4-201ENST00000486333 NEFLP07196 543 aa16.16■□□□□ 0.18
CTAGE4-201ENST00000486333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.16■□□□□ 0.18
CTAGE4-201ENST00000486333 TRIM52Q96A61 297 aa16.14■□□□□ 0.17
CTAGE4-201ENST00000486333 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CTAGE4-201ENST00000486333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.11■□□□□ 0.17
CTAGE4-201ENST00000486333 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms