Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GGTLC3B5MD39 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms