Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN10P78369 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN10P78369 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.9 ms