Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.7 ms