Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms