Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CASP4P49662 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP4P49662 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms