Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANGAP1P46060 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms