Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFNP31947 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFNP31947 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFNP31947 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms