Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA5P28066 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms