Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms