Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms