Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBASH3AP57075 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms