Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPB2P35606 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms