Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARID4AP29374 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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