Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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