Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXQ1Q9C009 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms