Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBASH3AP57075 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms