Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCP1P13796 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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LCP1P13796 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LCP1P13796 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LCP1P13796 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCP1P13796 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCP1P13796 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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