Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPOP42166 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms