Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
BRS3P32247 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
BRS3P32247 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms