Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms