Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 RN7SL453P-201ENST00000620275 329 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRMP28827 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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